in `arrange()`: ℹ In argument: `..1 = sample_name`. Caused by error: ! 找不到对象'sam...
🚨 错误信息
## 1 读入并对齐 ------------------------------------------------------------
> mat <- read_csv("geneMatrix_Control_normalized_log2cpm.csv") %>%
+ column_to_rownames("symble") %>% as.matrix()
Rows: 13692 Columns: 13
── Column specification ──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
Delimiter: ","
chr (1): symble
dbl (12): 6hC1, 6hC2, 6hC3, 24hC1, 24hC2, 24hC3, 72hC1, 72hC2, 72hC3, 120hC1, 120hC2, 120hC3
ℹ Use `spec()` to retrieve the full column specification for this data.
ℹ Specify the column types or set `show_col_types = FALSE` to quiet this message.
> meta <- read_csv("meta_Control.csv") %>% arrange(sample_name)
Rows: 12 Columns: 4
── Column specification ──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
Delimiter: ","
chr (2): symble, group
dbl (2): time, replicate
ℹ Use `spec()` to retrieve the full column specification for this data.
ℹ Specify the column types or set `show_col_types = FALSE` to quiet this message.
Error in `arrange()`:
ℹ In argument: `..1 = sample_name`.
Caused by error:
! 找不到对象'sample_name'
Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.
🤖 AI解决方案
Error in `arrange()`:
ℹ In argument: `..1 = sample_name`.
Caused by error:
! 找不到对象'sample_name'原因分析
meta 数据框中不存在名为 sample_name 的列，因此 arrange() 函数无法找到该列进行排序。
解决方案
将 meta 数据框的列名 symble 改为 sample_name，或者在 arrange() 函数中使用正确的列名（如果 meta 数据框中的列名并非 sample_name）。
假设 meta 数据框的实际列名是 symble，则修正后的代码为：
meta <- read_csv("meta_Control.csv") %>% arrange(symble)如果您确定 meta 数据框应该有一个名为 sample_name 的列，但它没有，您需要检查 meta_Control.csv 文件本身，或者在读取后进行列名的重命名，例如：
meta <- read_csv("meta_Control.csv")
colnames(meta)[colnames(meta) == "your_actual_column_name"] <- "sample_name" # 替换 your_actual_column_name 为实际列名
meta <- meta %>% arrange(sample_name)预防措施
- 在读取 CSV 文件后，立即使用
colnames()或glimpse()等函数检查数据框的列名，确保其与后续操作的预期一致。 - 在进行数据处理之前，确保所有涉及的列名在对应的数据框中都存在且拼写正确。